http://dbcls.nagahama-i-bio.ac.jp/health/modules/pukiwiki/ 健康への貢献遺伝子データベース 　"Database for Genes Contributing to Human Health" ja-jp 2012-04-09T18:24:47+09:00 http://dbcls.nagahama-i-bio.ac.jp/health/modules/pukiwiki/?Abstract 2012-04-06T09:31:22+09:00 テキストダウンロード （バイオの自習用教材） テキストダウンロード （被災大学の学生の方々のためのバイオの自習用教材） テキストダウンロード （被災大学の学生・院生が自習するためのバイオの情報解析教材） テキストダウンロード （被災大学の学生・院生が自習するためのバイオの情報解析教材） データベースへの新規データの登録手順、操作方法はこちら... y_sato, uehara http://dbcls.nagahama-i-bio.ac.jp/health/modules/pukiwiki/?text 2012-04-06T09:30:34+09:00 font(black){font(120%){バイオ分野の研究にはデータベースや計算機処理が重要になっていますが、我が国の学部教育では、この課題の授業や実習が不足していると言われています。本学で公開している以下のテキスﾄの内容は、バイオ・ライフ・分子生物学等の分野の実験系に進む学部生や院生にとって有用となるデータベースや情報解析ツールの使用法に関する自習用の教材です。文部科学省のライフサイエンス分野整備事業の学部レベルでの人材育成の為に作成・公開をしています。 font(120%){バイオ分... uehara http://dbcls.nagahama-i-bio.ac.jp/health/modules/pukiwiki/?comment 2011-04-21T17:43:24+09:00 ※学生のコメントは全て掲載してあり、誤字脱字を含む文章上の修正以外は、学生が記入した通りに記載した。順番は、コメントの分量の比較的多いものを先頭の方に、少ないものを後の方に掲載してある。 ※学生のコメントは全て掲載してあり、誤字脱字を含む文章上の修正以外は、学生が記入した通りに記載した。順番は、コメントの分量の比較的多いものを先頭の方に、少ないものを後の方に掲載してある。 ※学生のコメントは全て掲載してあり、誤字脱字を含む文章上の修正以外は、学生が記入した通りに記載した。順番は、コメントの分量... uehara http://dbcls.nagahama-i-bio.ac.jp/health/modules/pukiwiki/?text2 2011-04-21T17:41:20+09:00 本画面の下にある添付ファイルをクリックしてダウンロード下さい。 説明：各学生が、環境汚染物質の分解除去やバイオ燃料生産等に関係すると考えられる遺伝子類を独自に設定し、メタゲノム配列から既知遺伝子と相同な遺伝子を発掘して、アノテーション情報を新規に付加しデータベース化している。探索者の所属、名前入りで公開している。メタゲノム配列を対象とすることで、実習でありながら新規発見が行え、探索した新たな有用遺伝子候補は探索者の名前入りでデータベースに登録し公開している。説明：各学生が、抗生物質やサプリメン... uehara http://dbcls.nagahama-i-bio.ac.jp/health/modules/pukiwiki/?%A5%C6%A5%AD%A5%B9%A5%C8 2011-04-21T17:40:17+09:00 教材：次世代シーケンサー時代の超大規模ゲノム情報解析　ファイル名　n-bio超大規模ゲノム情報解析 「次世代シーケンサー時代の超大規模ゲノム情報解析」 説明：次世代シーケンサーの登場で情報爆発の時代を迎えた。大規模情報を解析できる人材の育成が急務である。次世代シーケンサーで解読した微生物ゲノム配列のアノテーションを行うための実習教材である。数百万本単位の大量配列を対象にLinuxを用いたプログラム処理の必要性や便利さを実感することが出来る。 教材：次世代シーケンサー時代の超大規模ゲノム情... ゲスト, uehara http://dbcls.nagahama-i-bio.ac.jp/health/modules/pukiwiki/?%B3%D8%B2%F1%C8%AF%C9%BD%A1%A6%B9%D6%BD%AC%B2%F1%A1%A6%BD%D0%C1%B0%BC%C2%BD%AC%C5%F9%A4%CE%BC%C2%C0%D3 2011-04-21T10:17:08+09:00 上原啓史（講師）“病気に関係する遺伝子の探索”，滋賀県立米原高等学校（本学），2011年3月29日. Abstract■学会発表、講習会 等 上原啓史(講師)，阿部貴志，棚橋佳世，濱野祐太，白井和英，池村 淑道，“自分が興味を持っている遺伝子がどの範囲の環境微生物に存在しているのかを知る講習会”，第１回遺伝学談話会（長浜），2008年1月.Hiroshi Uehara (lecturer), Toshimichi Ikemura, “Database for Genes Contributin... uehara http://dbcls.nagahama-i-bio.ac.jp/health/modules/pukiwiki/?%A5%C1%A5%E5%A1%BC%A5%C8%A5%EA%A5%A2%A5%EB 2011-01-19T09:26:05+09:00 探索手順の概要 （テキスト，データ様式は本画面下の添付ファイルをご参照下さい。）データベース操作説明 動画再生　jizoku.swf データベース操作説明 動画再生　jizoku.swf 持続可能型社会への貢献遺伝子データベースの画面ですが、操作方法は同じです 再生には、Flash Playerが必要です テキスト並びにデータ様式のダウンロード 本画面の下にある添付ファイルをクリックして、ダウンロードして下さい。 　　ファイル名　　　　　　内容 ●text200710.pdf ... y_sato, uehara http://dbcls.nagahama-i-bio.ac.jp/health/modules/pukiwiki/?%B3%D8%B2%F1%C8%AF%C9%BD%C5%F9 2010-12-16T15:45:09+09:00 上原啓史，阿部貴志，中泉友紀，池田俊，金谷重彦,池村淑道，“次世代シーケンサーによる個人ゲノム解読を含む大量配列解析の時代に必要となる人材の育成、並びにシニア世代研究者との共同作業によるデータベースの高品質化”，統合データベースプロジェクト シンポジウム2010，2010年10月5日(東京).上原啓史，和田千惠子，中泉友紀，古田亜耶乃，岩崎裕貴，池村淑道，阿部貴志，“環境ゲノム資源からの環境改善に役立つ有用タンパク質遺伝子セットの新規情報学的な手法による探索”，第33回日本分子生物学会年会, 2... uehara http://dbcls.nagahama-i-bio.ac.jp/health/modules/pukiwiki/?%A4%AA%CC%E4%B9%E7%A4%EF%A4%BB 2010-10-08T09:22:13+09:00 Abstract講習会・出前実習の依頼，ご意見 等がございましたら、 　h_uehara@nagahama-i-bio.ac.jp　長浜バイオ大学　生体分子情報学研究室　上原までご連絡願います。... uehara http://dbcls.nagahama-i-bio.ac.jp/health/modules/pukiwiki/?%A5%C6%A1%BC%A5%DE 2009-09-11T08:13:39+09:00 抗生物質　抗がん剤　 主なテーマの詳細情報 抗がん剤　　抗疲労物質　　降圧薬　　免疫抑制薬　　髪の保湿　　皮膚炎症抑制剤　　抗生物質　 ***↓ 登録されているテーマの一覧を見る 髪の保湿　　皮膚炎症抑制剤　　抗生物質?　 抗がん剤　　抗疲労物質　　降圧薬　　免疫抑制薬　　 髪の保湿　　皮膚炎症抑制剤　　コレステロール低下剤?　 抗加齢･健康補助?　　髪の保湿　　皮膚炎症抑制剤?　　シキミ酸合成?　　コレステロール低下剤?　 ... y_sato, uehara http://dbcls.nagahama-i-bio.ac.jp/health/modules/pukiwiki/?%A5%B7%A5%AD%A5%DF%BB%C0%B9%E7%C0%AE 2009-03-17T00:20:41+09:00 シキミ酸合成 ID テーマ 遺伝子検索用に使用した薬剤・物質名 遺伝子やタンパク質の英語名 遺伝子の略号 ご所属 23シキミ酸合成キナ酸脱水素酵素Quinate/shikimate dehydrogenase [Pyrroloquinoline-quinone](EC 1.1.99.25) (NAD(P)-independent quinate dehydrogenase).Name=quiA; OrderedLocusNames=ACIAD1716Nagahama Institute of ... uehara http://dbcls.nagahama-i-bio.ac.jp/health/modules/pukiwiki/?%C0%B0%C4%B2%BA%DE 2009-03-17T00:20:41+09:00 整腸剤 ID テーマ 遺伝子検索用に使用した薬剤・物質名 遺伝子やタンパク質の英語名 遺伝子の略号 ご所属 26整腸剤乳酸菌Acyl carrier protein (ACP).Name=acpP; OrderedLocusNames=LBA1307;Nagahama Institute of Bio-science and Technology27整腸剤乳酸菌Probable thiamine biosynthesisprotein thiI.Name=thiI; OrderedLocusN... uehara http://dbcls.nagahama-i-bio.ac.jp/health/modules/pukiwiki/?%B9%B3%A4%A6%A4%C4%BA%DE 2009-03-17T00:20:41+09:00 抗うつ剤 ID テーマ 遺伝子検索用に使用した薬剤・物質名 遺伝子やタンパク質の英語名 遺伝子の略号 ご所属 25抗うつ剤フルオキセチンNose resistant to fluoxetine protein 6 precursor (Protein nrf-6)Name=nrf-6; ORFNames=C08B11.4Nagahama Institute of Bio-science and Technology53抗うつ剤フルオキセチンNose resistant to fluoxetin... uehara http://dbcls.nagahama-i-bio.ac.jp/health/modules/pukiwiki/?%B9%B3%C0%B8%CA%AA%BC%C1 2009-03-17T00:20:41+09:00 抗生物質 ● ライフサイエンス辞書 http://lsd.pharm.kyoto-u.ac.jp/ja/se­rvice/weblsd/index.html 3.1.　実習手順 今までは色々な事項を説明して来ましたので、ここで実習手順の概要をまとめておきます。 ? 持続可能型社会の実現に、貢献が期待できる可能性を持つ遺伝子やタンパク質の候補を探します。 （使用サイト等：Google，ライフサイエンス辞書、NCBI PubMed?，専門誌や書籍） ? 得られた遺伝子やタンパク... uehara http://dbcls.nagahama-i-bio.ac.jp/health/modules/pukiwiki/?%A5%B3%A5%EC%A5%B9%A5%C6%A5%ED%A1%BC%A5%EB%C4%E3%B2%BC%BA%DE 2009-03-17T00:20:41+09:00 コレステロール低下剤 データベースから遺伝子を検索できます。 ページ内の検索 単語検索 データベースから遺伝子を検索するにはこちらをクリック。 単語検索? uehara